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新算法将任何肿瘤细胞与最佳可能的抗癌治疗相

发布时间:2019-03-22 10:44:07

新算法将任何肿瘤细胞与最佳可能的抗癌治疗相匹配 2007年7月24日 癌症患者没有时间浪费。然而,许多人经历了几种不同的治疗,以找到一种对他们特定类型的肿瘤更有效的治疗方法

  新算法将任何肿瘤细胞与最佳可能的抗癌治疗相匹配

  2007年7月24日

  癌症患者没有时间浪费。然而,许多人经历了几种不同的治疗,以找到一种对他们特定类型的肿瘤更有效的治疗方法。

  因此,一种能够帮助快速分类患者特定肿瘤的分子信息并将这些信息与正确的药物治疗相匹配的算法将是一项具有巨大价值的突破.Dan Theodorescu,MD,Ph.D.,a University of a弗吉尼亚州肿瘤学家和癌症生物学家,以及计算生物学家和生物信息学统计学家Jae Lee博士已经开创了这样一个系统。这项工作涉及与国家癌症研究所,GeneLogic公司和弗吉尼亚大学计算机公司的同事合作。科学部。他们在7月23日的一周发表了他们的结果,在美国国家科学院的早期版本,在线发现。

  研究人员使用来自国家癌症研究所(NCI-60)的60种不同的人类癌症细胞系组成的小组,设计并测试了一种算法,该算法旨在匹配特定患者特定肿瘤的最佳潜在治疗方案。

  以前,NCI-60细胞系用于筛选超过100,000种化合物的抗癌活性。然而,这些药物反应与患者的临床有效性无关。另一个问题是60个细胞系不包括所有重要的癌症类型(例如,某些膀胱癌,淋巴瘤和小细胞肺癌不在所研究的60个细胞系中)。

  研究人员调查了60种癌细胞系的药物敏感性数据是否可以外推到其他肿瘤或癌细胞系的有用信息中。事实上,他们发现他们的共表达推断(COXEN)系统可用于准确预测膀胱癌细胞系对两种常见化学疗法,顺铂和紫杉醇的药物敏感性。

  “即使这个NCI细胞集不是癌症细胞的详尽百科全书,我们发现我们可以利用现有数据得出我们正在探索的其他细胞类型的结论。该算法是Rosetta石,用于从NCI研究的药物转化为任何其他细胞系或人类肿瘤,“UVa Paul Mellon前列腺癌研究所主任,该研究的资深作者Theodorescu博士说。”我们相信我们有发现了一种有效的个性化癌症治疗方法。“UVa研究小组能够预测乳腺癌患者的临床反应,这些患者使用常用的化疗药物,多西紫杉醇和他莫昔芬治疗。

  相关故事研究提出致死性脑癌的新治疗策略2100年可以根除宫颈癌抗癌免疫治疗可以用来对抗HIV这项研究最令人兴奋的方面是,除了预测患者对治疗的反应外,COXEN算法还可用于发现任何形式的癌症中的有效化合物。根据该算法的性质,该算法在分子水平上检测癌细胞和药物活性,这些新发现的药物应该对患者有效。

   使用COXEN预先筛查有效性应大大降低测试新化合物的临床试验的失败率。同样,随着研究实验室药物发现时间的减少,药物的成本也会降低。基本上它使化学家使药物更接近临床,节省时间。

  因为NCI-60细胞系已用于筛选数千种化学成分确定的化合物和天然提取物用于抗癌活性,“我们能够对可能患有其他类型癌症的真实患者可能起什么样的化合物作出重要预测”。西奥多雷斯库说。研究人员使用COXEN筛选45,545种化合物,他们发现了几种具有抗膀胱癌活性的新化合物。为了与科学界分享这一激动人心的能力,李博士领导开发基于网络的COXEN系统(www.coxen.org),研究人员可以获得癌细胞或患者肿瘤的基因组分析数据,以获得FDA的化学敏感性预测结果。 - 批准的化学治疗化合物。

  Theodorescu博士正计划针对膀胱癌的新化合物进行临床试验。另一项计划的临床试验将使用FDA批准的药物检查接受COXEN个性化二线药物组合的多种癌症患者,以击败癌症。许多新的和令人兴奋的发现仍有待制定,甚至更快,成本更低。

  出处:http://www.virginia.edu