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定制的基因芯片将为神经母细胞瘤的预后提供线

发布时间:2019-03-21 19:35:37

定制的基因芯片将为神经母细胞瘤的预后提供线索 2005年8月2日 遗传学研究人员开发了一种定制的基因芯片,可快速扫描肿瘤样本中的特定DNA变化,为神经母细胞瘤(一种常见的儿童

  定制的基因芯片将为神经母细胞瘤的预后提供线索

  2005年8月2日

  遗传学研究人员开发了一种定制的基因芯片,可快速扫描肿瘤样本中的特定DNA变化,为神经母细胞瘤(一种常见的儿童癌症)提供预后线索。

  微阵列不是覆盖整个基因组,而是关注染色体的可疑区域,以寻找已知在癌症中发挥作用的缺失遗传物质的迹象。

  来自费城儿童医院和托马斯杰斐逊大学的研究人员表示,他们的技术可能很容易适应其他类型的癌症。原理证明研究出现在8月份的基因组研究中。

  共同作者,费城儿童医院的儿科肿瘤学家John M. Maris博士表示,他们的技术的一个优点是灵活性。“由于未来的研究确定其他活跃于神经母细胞瘤的基因,我们可以修改微阵列以包括这些地区,“他补充道。

  “我们为神经母细胞瘤定制了这种工具,但这种方法也可能适用于其中DNA变化很重要的其他类型的癌症,”共同作者Paolo Fortina博士,医学博士,杰斐逊医学院医学教授说。费城托马斯杰斐逊大学和杰斐逊医学院转化医学中心基因组学和诊断学部门主任。

  在婴儿中发现最常见的癌症,神经母细胞瘤撞击周围神经系统,通常在儿童的胸部或腹部出现为实体肿瘤。某些类型的神经母细胞瘤风险较低,在外科医生切除肿瘤后解决,而其他类型更多确定正确的风险等级可以让医生适当地治疗侵袭性癌症,同时不会让患有低风险癌症的儿童接受过度治疗。

  癌症研究人员已经确定了影响神经母细胞瘤侵袭性的特定遗传异常。一个重要的异常是杂合性缺失(LOH),一对基因的一个拷贝的缺失。当涉及的基因是肿瘤抑制基因时,LOH消除了对不受控制的细胞生长的制动,这种生长是癌症的标志。

  Maris博士“实验室的研究人员之前已经确定11号染色体区域内的LOH可以使侵袭性神经母细胞瘤得到控制。新的微阵列可以检测11号染色体和其他与神经母细胞瘤有关的遗传区域的基因缺陷。

  相关故事Promega与Broad Institute签署许可协议以获取CRISPR-Cas9技术CRISPR技术创造了对免疫系统“看不见”的多能干细胞研究人员描述了第一例受SLC28基因家族功能障碍影响的患者微阵列是含有严格有序遗传选择的硅芯片可以测试样品材料的材料。当来自样品的DNA碱基与微阵列上的互补序列结合时,它们使荧光标签在激光下发光。这是样品中存在特定基因变异的信号。

  “我们可以测试来自外周血和肿瘤的DNA,我们应该看到癌症中的信号丢失,”Fortina博士说。他指出,研究人员可以同时评估已知参与神经母细胞瘤的七个染色体区域。

  与基因表达微阵列不同,基因表达微阵列检测不同水平的RNA以测量不同基因的活性水平,因为DNA将信息传递给RNA,目前的微阵列直接识别DNA的变化。 “这些DNA变化,涉及遗传物质的获得或丧失,对神经母细胞瘤的预后很重要,”Maris博士说。

  该技术可能有助于确定临床诊断,该技术可能有助于确认临床诊断,Cardeza血液学研究基金会和血液学研究所医学教授兼研究副主任Saul Surrey博士说。杰斐逊医学院。如果不知道临床诊断,该方法可能会提供一些线索。

  该论文中描述的微阵列仅用于他们的实验室研究,但研究人员希望通过进一步的研究,它可以作为肿瘤学家治疗神经母细胞瘤患者以及可能用于其他癌症的诊断工具。

  除了Drs。 Maris,Fortina和Surrey,其他共同作者是George Hii,Peter S. White博士和费城儿童医院的Eric Rappaport博士,以及Craig A. Gelfand,Ph新泽西州普林斯顿Orchid Biosciences公司的Shobha Varde,MS,美国国立卫生研究院和儿童肿瘤学组的资助支持了这项工作。

  

  出处:http://www.jefferson.edu/